Laboratoriokäsikirja

Ulosteen bakteeripatogeenit, nukleiinihappo (kval) (F -BaktNhO/F -BaktVIP)

F -BaktNhO (12356)

Multiplex-tutkimus, joka sisältää osatutkimukset:

F -CampNhO, F -Campylobacter jejuni/coli, nukleiinihappo (kval) 12694
F -SalmNhO, F -Salmonella spp., nukleiinihappo (kval) 12695
F -YersNhO, F -Yersinia enterocolitica, nukleiinihappo (kval) 12696
F -ShigNhO, F -Shigella spp./EIEC (enteroinvasiivinen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12697
F -EHECNhO, F -EHEC (enterohemorraginen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12698
F -ETECNhO, F -ETEC (enterotoksigeeninen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12699
F -EPECNhO, F -EPEC (enteropatogeeninen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12700
F -EAECNhO, F -EAEC (enteroaggregatiivinen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12701

Indikaatiot

Bakteerien aiheuttaman ripulitaudin (etenkin turistiripulin) epäily.
Tutkimukseen sisältyy ulosteen bakteeripatogeenien osoitus nukleiinihaponosoituksella ja viljeltävissä olevien löydösten osoittaminen viljelyvarmistuksella.
Tutkimukseen sisältyvät patogeenit: Campylobacter, Salmonella, Yersinia enterocolitica/pseudotuberculosis, Shigella, enterohemorraginen E. coli EHEC, enterotoksigeeninen E. coli ETEC, enteropatogeeninen E. coli EPEC, enteroaggregatiivinen E. coli EAEC ja enteroinvasiivinen E. coli EIEC.  
Viljelyvarmistettavia löydöksiä ovat Campylobacter, Salmonella, Yersinia, Shigella ja enterohemorraginen E. coli EHEC. Varmistuksen yhteydessä löydöksille tehdään myös herkkyysmääritys. EHEC-löydökselle ei määritetä herkkyyttä.
Ripulia aiheuttavista E. coli -kannoista ETEC-, EPEC-, EAEC- ja EIEC-kannat on mahdollista osoittaa vain nukleiinihaponosoituksella.

Näyte

Ulostenäytettä eNAT-putkessa ja geelikuljetusputkessa.

Lähetetietoihin merkitään potilaan henkilötunnuksen lisäksi ammatti, kotikunta, oireet ja mahdolliset ulkomaanmatkat viimeisen 6 kk:n ajalta sekä antibioottihoidot. Näyte on otettava ennen antibioottihoidon aloittamista tai 2 viikkoa lopettamisen jälkeen.

Säilytys ja lähetys

Kuljetusta odottavat näytteet säilytetään jääkaapissa (+2 - +8°C) ja lähetetään huoneenlämmössä.

Ulostenäyte eNAT-kuljetusputkessa säilyy jääkaapissa 7 vrk näytteenotosta.
Ulostenäyte geelikuljetusputkessa (Transpocult) säilyy tutkimuskelpoisena jääkaapissa enintään 4 vrk näytteenotosta, mutta se tutkitaan positiivisesta NhO-tuloksesta myös tämän jälkeen.

Menetelmä

Nukleiinihaponosoitus multiplex-PCR-tekniikalla. Viljeltävissä olevien, positiivisten löydösten viljely erikoiselatusaineilla, tunnistaminen ja herkkyysmääritys viljelylöydöksistä. Akkreditoitu menetelmä.

Toimitusaika

3-4 työpäivää (positiivisen löydöksen mahdollinen viljelyvarmistus noin 7 työpäivää)

Viitearvot

Normaalisti negatiivinen.

Tulkinta

Positiivisessa näytteessä löydökset vastataan omille osatutkimuksilleen.

Kommentti

Geelikuljetusputken puuttuminen ei estä tutkimusta mutta viljelyvarmistusta ei voida tehdä.

Enteroinvasiivinen E. coli EIEC on hyvin samankaltainen Shigellan kanssa, eikä niitä ole mahdollista erottaa nukleiinihaponosoituksella. Tämän vuoksi nukleiinihappolöydös vastataan näissä tapauksissa Shigella spp./EIEC.
Nukleiinihaponosoituksella voidaan osoittaa patogeeninen Yersiniat (Y. Enterocolitica.

Alihankinta

Kyllä.

Konsultointi

Mikrobiologi Taru Meri
puh. 044 0185731
taru.meri@vita.fi

Mikrobiologi Hanna Nihtilä
puh. 040 922 4819
hanna.nihtila@vita.fi