Ulosteen bakteeripatogeenit, nukleiinihappo (kval) (F -BaktNhO/F -BaktVIP)
PDFF -BaktNhO (12356)
- Multiplex-tutkimus, joka sisältää osatutkimukset:
F -CampNhO, F -Campylobacter jejuni/coli, nukleiinihappo (kval) 12694
F -SalmNhO, F -Salmonella spp., nukleiinihappo (kval) 12695
F -YersNhO, F -Yersinia enterocolitica, nukleiinihappo (kval) 12696
F -ShigNhO, F -Shigella spp./EIEC (enteroinvasiivinen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12697
F -EHECNhO, F -EHEC (enterohemorraginen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12698
F -ETECNhO, F -ETEC (enterotoksigeeninen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12699
F -EPECNhO, F -EPEC (enteropatogeeninen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12700
F -EAECNhO, F -EAEC (enteroaggregatiivinen E. coli), nukleiinihappo (kval) 12701 - Indikaatiot
- Bakteerien aiheuttaman ripulitaudin (etenkin turistiripulin) epäily.
Tutkimukseen sisältyy ulosteen bakteeripatogeenien osoitus nukleiinihaponosoituksella ja viljeltävissä olevien löydösten osoittaminen viljelyvarmistuksella.
Tutkimukseen sisältyvät patogeenit: Campylobacter, Salmonella, Yersinia enterocolitica/pseudotuberculosis, Shigella, enterohemorraginen E. coli EHEC, enterotoksigeeninen E. coli ETEC, enteropatogeeninen E. coli EPEC, enteroaggregatiivinen E. coli EAEC ja enteroinvasiivinen E. coli EIEC.
Viljelyvarmistettavia löydöksiä ovat Campylobacter, Salmonella, Yersinia, Shigella ja enterohemorraginen E. coli EHEC. Varmistuksen yhteydessä löydöksille tehdään myös herkkyysmääritys. EHEC-löydökselle ei määritetä herkkyyttä.
Ripulia aiheuttavista E. coli -kannoista ETEC-, EPEC-, EAEC- ja EIEC-kannat on mahdollista osoittaa vain nukleiinihaponosoituksella. - Näyte
- Ulostenäytettä eNAT-putkessa, Fecal Swab -putkessa ja geelikuljetusputkessa.
Lähetetietoihin merkitään potilaan henkilötunnuksen lisäksi ammatti, kotikunta, oireet ja mahdolliset ulkomaanmatkat viimeisen 6 kk:n ajalta sekä antibioottihoidot. Näyte on otettava ennen antibioottihoidon aloittamista tai 2 viikkoa lopettamisen jälkeen. - Säilytys ja lähetys
- Kuljetusta odottavat näytteet säilytetään jääkaapissa (+2 - +8°C) ja lähetetään huoneenlämmössä.
Ulostenäyte eNAT-kuljetusputkessa säilyy jääkaapissa 7 vrk näytteenotosta.
Ulostenäyte FecalSwaB-putkessa säilyy jääkaapissa 4 vrk näytteenotosta.
Ulostenäyte geelikuljetusputkessa (Transpocult) säilyy tutkimuskelpoisena jääkaapissa enintään 4 vrk näytteenotosta, mutta se tutkitaan positiivisesta NhO-tuloksesta myös tämän jälkeen. - Menetelmä
- Nukleiinihaponosoitus multiplex-PCR-tekniikalla. Viljeltävissä olevien, positiivisten löydösten viljely erikoiselatusaineilla, tunnistaminen ja herkkyysmääritys viljelylöydöksistä. Akkreditoitu menetelmä.
- Toimitusaika
- 3-4 työpäivää (positiivisen löydöksen mahdollinen viljelyvarmistus noin 7 työpäivää)
- Viitearvot
Normaalisti negatiivinen.
- Tulkinta
- Positiivisessa näytteessä löydökset vastataan omille osatutkimuksilleen.
- Kommentti
- Geelikuljetusputken puuttuminen ei estä tutkimusta mutta viljelyvarmistusta ei voida tehdä.
Enteroinvasiivinen E. coli EIEC on hyvin samankaltainen Shigellan kanssa, eikä niitä ole mahdollista erottaa nukleiinihaponosoituksella. Tämän vuoksi nukleiinihappolöydös vastataan näissä tapauksissa Shigella spp./EIEC.
Nukleiinihaponosoituksella voidaan osoittaa patogeeninen Yersiniat (Y. Enterocolitica. - Alihankinta
- Kyllä.
- Konsultointi
Mikrobiologi Taru Meri puh. 044 0185731 taru.meri@vita.fi Mikrobiologi Hanna Nihtilä puh. 040 922 4819 hanna.nihtila@vita.fi